3个伞形科植物CPP基因家族的比较基因组学分析

作者：巩克; 王希胤^*

来源：种子科技, 2021, 39(16): 11-16.

DOI：10.19904/j.cnki.cn14-1160/s.2021.16.005

• 伞形科
• 基因家族
• CPP-like

CPP基因家族是一个转录因子家族,具有多种生物学功能。通过利用比较基因组学的方法,对芹菜、香菜和胡萝卜3个伞形科的物种进行分析,并将结果与莴苣、葡萄和拟南芥的CPP基因家族进行比较。结果显示,在3个伞形科物种中共鉴定了26个基因,其中芹菜、香菜和胡萝卜中分别有8个、12个和6个;香菜中的同源基因数量远大于芹菜和胡萝卜;全基因复制在CPP基因家族的扩张中发挥了重要的作用。同时,通过RNA-seq分析了不同组织中CPP基因的表达,将为伞形科中CPP和其他基因家族的比较和功能分析提供参考。

• 单位
  华北理工大学