基于RNA-seq技术的宫颈癌与癌旁组织差异表达基因分析

作者：张志珊; 蒋燕成; 陈紫萱; 陈婉花; 李爱禄; 李纯孝

来源：实用癌症杂志, 2017, 32(12): 1915-1917.

• 宫颈癌
• RNA-seq
• 转录组
• 差异表达基因
• 融合基因

目的探讨宫颈癌的发病机制。方法应用RNA-seq技术分析3对宫颈癌及癌旁组织转录组,利用生物信息方法对差异基因进行基因本体(GO)分析和通路富集性分析。结果在宫颈癌组织中发现1755个差异表达基因,其中758个基因表达上调,997个基因表达下调。功能富集分析表明,差异基因富集于细胞粘附、DNA损伤有关的信号通路上。且宫颈癌组织中发现RAB22A-BCAS1等融合基因。结论细胞粘附信号通路、RAB22A-BCAS1融合基因可能与宫颈癌的发生机制有关。

• 单位
  福建医科大学附属泉州第一医院