与甘蔗间作的花生叶片转录组分析

作者：吴海宁; 黄志鹏; 贺梁琼; 熊发前; 钟瑞春; 韩柱强; 蒋菁; 刘菁; 阳太亿; 唐荣华; 唐秀梅^*

来源：分子植物育种, 2020, 18(13): 4188-4196.

DOI：10.13271/j.mpb.018.004188

• 花生
• 间作
• 转录组
• 差异表达基因

为研究间作甘蔗对花生相关基因的表达调控及响应机制,以花生叶片作为材料,使用Illumina NovaSeq 6000高通量测序技术,对间作花生离甘蔗较近的边行(IPAleaf)、间作花生离甘蔗较远的中间行(IPBleaf)及单作花生(MPleaf)叶片进行转录组的测序分析。将各样本获得的转录组数据进行两两比较,MPleafvsIPAleaf、MPleafvsIPBleaf和IPBleafvsIPAleaf的差异表达基因数分别是1 806个、968个、1 302个,其中上调表达基因分别占61.13%、48.24%、65.05%。GO功能富集分析显示差异表达基因主要涉及细胞壁组织或生物合成、碳水化合物生物合成与代谢过程、细胞多糖生物合成与代谢过程、细胞葡聚糖生物合成与代谢过程、催化活性、氧化还原酶活性及过程等。KEGG富集分析表明差异表达基因主要涉及的代谢通路有苯丙素类生物合成、α-亚麻酸代谢、淀粉和蔗糖的代谢、类黄酮生物合成等。本研究通过花生叶片转录组分析,为研究间作花生叶片基因的表达调控机制提供基础数据资料。

• 单位
  广西壮族自治区农业科学院经济作物研究所