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摘要
目的利用BOOST交互作用筛选方法,查找交互作用后进行通路的发现,为疾病易感性基因的查找提供帮助。方法以WTCCC的Ⅰ期公开数据中1型糖尿病的数据为原始数据,结合BOOST方法进行交互作用分析,通过通路富集分析发现通路。结果发现了10条通路,其中有2条通路位于HLA区域外部,其余8条通路都在HLA区域内部,且通路中所包含的主要交互作用基因彼此之间存在重叠。结论利用BOOST交互作用筛选方法可有效地作为通路发现的手段,可弥补传统只考虑单变量的不足,为通路发现提供更多的可解释性。
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单位哈尔滨医科大学; 深圳市蛇口人民医院; 深圳市南山区慢性病防治院
