不明原因复发性流产患者的基因表达谱亚组分析

作者：林泳煌; 刘兴华; 王红心; 杨晓雨; 樊文龙; 陈东宇; 何玉清

来源：中国妇幼保健, 2022, 37(19): 3629-3634.

DOI：10.19829/j.zgfybj.issn.1001-4411.2022.19.038

• 复发性流产
• 亚组分析
• 批次效应
• 一致性聚类

目的 探讨不明原因的复发性流产(RSA)患者的基因表达谱的异质性，确定亚组子宫内膜生物学过程的区别。方法 从GEO数据库中获取GSE165004和GSE26787基因表达序列，应用ComBat方法去除批次效应后，应用Consensus Clustering方法对29个病例组进行无监督聚类并分成3个亚组(RSA1、RSA2、RSA3),3个亚组再分别与对照组进行差异表达分析。利用GO富集和KEGG富集对差异表达基因(DEGs)进行生物学功能和途径注释。应用cytoHubba识别中心基因。结果 RSA1和对照组主要富集在与核分裂、细胞分裂等细胞周期相关，代谢途径有蛋白质消化吸收和细胞外基质(ECM)受体相互作用；RSA2组和脂质、氨基酸代谢过程的调控有关，代谢途径主要有花生四烯酸代谢和甲状腺激素合成；RSA3组和金属离子等细胞信号有关。结论 RSA1亚组的细胞周期明显失调；RSA2亚组的脂质、氨基酸代谢失调；RSA3亚组的细胞信号失调。

• 单位
  公共卫生学院; 广东医科大学