基于生物信息学的肩袖撕裂与绝经后骨质疏松症的共病研究

作者：汪青; 钱胤华; 钱平康; 徐锋^*

来源：医学信息(上旬刊), 2023, 36(15): 6-11.

• 绝经后骨质疏松症
• 肩袖撕裂
• 共病
• 信号转导和转录激活因子3
• 白介素6
• 血管内皮生长因子A
• 金属基质蛋白酶2

目的 探讨肩袖撕裂（RCT）与绝经后骨质疏松症（PMOP）之间的关系，为肩袖撕裂及绝经后骨质疏松症的共病研究提供新的思路。方法 收集自2021年1月1日-2022年6月30日因肩袖撕裂住院的绝经后女性患者的骨密度，并进行分析。应用生物信息学的方法，构建PMOP与RCT共同靶基因的PPI网络，使用cytoscape软件插件cytohubba按照Degree筛选筛选核心基因，并使用R语言进行GO及KEGG富集分析。结果 共入组受试者104例，骨量异常共67例，占64.42%，其中骨质疏松症为17例，占16.35%。60岁以上人群，骨质疏松症约占1/3。通过查询数据库共获得绝经后骨质疏松症相关基因共967个，肩袖撕裂相关基因共281个，共同靶点152个。筛选获取前20位核心靶点，包括：信号转导和转录激活因子3(STAT3)、白介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、金属基质蛋白酶2(MMP2)等。GO生物学过程主要集中在腺体发育、细胞对氧化应激的反应等，KEGG主要富集在癌症中的蛋白聚糖、雌激素信号通道等。结论 肩袖撕裂和绝经后骨质疏松症共病在临床常见，两者具有一定的相关性。未来可以从炎症、血管再生、氧化应激和雌激素相关信号通道进行研究。