高等学校内部审计作为行政事业单位内部控制的重要内容,是我国高校实现内涵式发展的坚实基础和有利支撑,新时代这一新的历史方位又赋予了其理论更加深刻的内涵。文章以新时代高校内部审计为背景,阐述了新时代高校内部审计基础理论创新的必要性,从内部审计本质、目标、职能、环境四个方面完善具有中国特色的新时代高校内部审计基础理论体系,以期促进其理论研究与政策制定、实务工作的有机融合。