颅内肿瘤的特征基因筛选和临床检验

作者：高岩; 王辰^*

来源：武警后勤学院学报(医学版), 2021, 30(04): 36-43.

DOI：10.16548/j.2095-3720.2021.04.008

• 颅内肿瘤
• 肿瘤标志物
• 差异分析

【目的】生物信息学方法建立全面的颅内肿瘤微小RNA(microRNA,miRNA)差异表达基因谱以及初步筛选基于该恶性肿瘤样本的标志物进行临床检验。【方法】分析不同组之间差异表达的miRNA;进行GO(gene ontology)富集分析(biological process、molecular function和cellular component)及KEGG通路富集分析;进行miRNA靶基因的预测;筛选两个最为重要的基因作为颅内肿瘤的标志物,ELISA方法进行临床患者的检测,计算阳性率。【结果】与对照组相比,鉴定出14个差异表达的miRNA,包括5个上调miRNA和9个下调miRNA;利用富集分析,差异基因主要集中在response to oxygen levels和response to decreased oxygen levels通路中;两个重要的靶点基因为SP1和AGO1。与对照组相比,颅内肿瘤患者SP1和AGO1存在显著的降低(P<0.01)。【结论】SP1和AGO1可作为颅内肿瘤的两个潜在的有效临床生物标志物。

• 单位
  天津医院; 环湖医院