摘要
为了筛选基因VII型新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)W蛋白与鸡胚成纤维细胞(DF-1)的互作蛋白,本研究构建了基因VII型毒株W基因的重组真核表达质粒,将重组质粒转染DF-1细胞48 h后收集样品,经免疫沉淀法、SDS-PAGE电泳胶条回收、蛋白酶解、串联质谱测序技术等步骤,剔除空白对照组的非特异性蛋白后,共鉴定到227条肽段和77个宿主蛋白与W蛋白互作。GO分析显示,这些与W蛋白互作的宿主蛋白主要富集在细胞加工(41个)、蛋白/DNA结合(46个)、细胞定位(22个)、转录调控(1个)等;KEGG分析显示,这些宿主蛋白主要与核糖体(8个)、代谢途径(6个)、RNA运输(5个)等信号通路有关;PPI网络显示,有40个宿主蛋白形成了以核糖体相关蛋白、核输入相关蛋白、肌动蛋白为中心的互作网络,其中宿主蛋白YWHAZ、KPNB1、KPNA5、RPS8、RPS25、NACA、DDX3X等均涉及上述功能注释,推测W蛋白可能参与转录翻译、转录调控、核转运活动相关。进一步通过免疫共沉淀试验验证了W蛋白与YWHAZ蛋白存在互作关系,这一发现将为NDV W蛋白的作用机制提供基础数据。
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