肠道微生物次级代谢产物化学结构新颖、生物活性多样。目前发现的肠道微生物代谢产物主要包括环二肽及多肽类、生物碱类、内酯类、环酰胺类等,肠道微生物在抗菌、抗病毒、抗炎等方面表现出巨大的研究前景。本文对近几年来肠道微生物来源的次级代谢产物的结构特征、生物活性及肠道微生物在疾病治疗方面的研究进展进行总结和综述。