随着我国体制改革的深入和经济社会的发展,对事业单位内部管理要求越来越高。从内控角度出发,要求内部管理要逐步从以问题为导向逐步转变为以目标和结果为导向,加强管理过程中的事前和事中控制。预算通过事前量化计划来协调和控制资源的获得、配置和使用,不但能优化资源配置,而且能促进单位整体管理水平的提升。但是,科研事业单位因其自身的独特之处,在预算编制、执行控制和评价考核等方面都存在管理难点,本文着重对这些难点进行分析,并就如何优化管理提出可行性的建议。