玉米木质形成素类AGP蛋白基因家族的生物信息学分析

作者：钟静; 胡颖

来源：生物技术, 2016, (04): 353-358.

DOI：10.16519/j.cnki.1004-311x.2016.04.0061

• 玉米
• 木质形成素
• 阿拉伯半乳糖蛋白
• 理化性质
• 结构特征 maize
• xylogen
• arabinogalactan proteins
• physical and chemical properties
• structure characteristic

[目的]鉴定玉米木质形成素类AGP蛋白(Xylogen-like arabinogalactan protein,XYLP)基因家族成员,并预测分析其理化性质、蛋白结构和系统发生树。[方法]采用生物信息学方法鉴定玉米XYLP成员,对其蛋白的理化性质、疏水性、亚细胞定位、系统发生树、结构域、蛋白质二/三级结构等方面进行预测和分析。[结果]从玉米基因组中共鉴定出16个ZmXYLPs基因;其蛋白产物全长在126~304氨基酸之间,理论等电点在5.53~9.18之间,不稳定系数在25.19~55.66之间,平均疏水指数在-0.098~0.698之间,主要定位在质膜上;二级结构均由α螺旋、无规则卷曲和延...

• 单位
  杂交水稻国家重点实验室; 武汉大学; 湖北第二师范学院