遵式作为百部忏主,在忏悔的理念方法上颇有建树。他重视对天台忏法文献的整理与勘定,制作多部新的忏仪,既尊重传统,又有所创造。他的忏悔理念有鲜明的革新色彩,提倡施食在忏仪中的运用,推崇斋忌,反对世俗祭祀,推动净土与天台忏法的结合。他还对当时社会忏悔实践中存在的不如法现象进行反思与批判,并提出整治措施。遵式的忏悔理念与方法对后世影响深远。