摘要
目的通过数据库数据分析RNF144A基因在皮肤恶性黑色素瘤(SKCM)中的表达及在诊断和治疗中的潜在意义。方法通过GEPIA网站和Oncomine数据库分析RNF144A基因在常见肿瘤及SKCM中的表达情况,基于UALCAN数据库对RNF144A基因在SKCM中表达进行样本类型、肿瘤分期、年龄、体重、性别、种族的亚组分析,通过OncoLnc网站绘制RNF144A基因表达与SKCM患者生存周期相关曲线,基于UALCAN数据库查找在SKCM中RNF144A的共表达基因,通过String数据库分析RNF144A基因的蛋白相互作用及上下游调控关系。结果 RNF144A基因的差异性表达分析发现,RNF144A基因在SKCM、急性髓系白血病、胃腺癌、胸腺瘤中高表达,在宫颈鳞癌和腺癌、子宫内膜癌、子宫内膜肉瘤中低表达,并且SKCM的肿瘤组和正常组中RNF144A基因表达存在显著差异。亚组分析发现,SKCM男性患者的RNF144A基因表达高于女性患者;生存分析发现,SKCM中RNF144A高表达组患者生存周期明显短于低表达组;基因共表达分析发现,Pearson-CC大于0.5的基因共表达基因有602个;蛋白质网络分析发现,RNF144A基因可能与PRKDC、UBC、RPS27A、UBB、UBA52、UBE2L3、CMPK2、TSSC1、MRPL37、RNFT2等蛋白相互作用。结论通过数据挖掘发现,RNF144A在SKCM组织中高表达,参与肿瘤的发生、发展,与患者预后显著相关,可作为诊断和治疗的潜在靶点。
-
单位湖南中医药大学; 湖南省中医药研究院附属医院