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摘要
目的 获得链霉菌V-1-3的基因组序列信息，分析其次级代谢产物生物合成基因簇并预测其代谢产物，为发现潜在新抗生素奠定基础。方法 基于16S rRNA基因序列进行菌株属水平鉴定，利用Illumina HiSeq+PacBio测序技术对菌株V-1-3进行基因组测序，采用antiSMASH(v6.0.1)在线工具分析次级代谢产物生物合成基因簇，液-质联用技术检测产生的次级代谢产物。结果 链霉菌V-1-3基因组序列全长8 243 417 bp，平均(G+C)含量为72.14%，共编码7578个基因，预测到33个生物合成基因簇，利用液-质联用检测到4个代谢物：oxalomycin B、geosmin、coelichelin和ishigamide。结论 来自盐碱地的链霉菌V-1-3具有丰富的次级代谢产物生物合成基因簇，能产生多种次级代谢产物，具有进一步发掘新抗生素的价值。
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