基于生物信息学分析乳酸脱氢酶A在肺腺癌中的表达及其临床意义

作者：张轶; 王菊勇^*

来源：重庆医学, 2021, 50(16): 2804-2812.

• 肺腺癌
• 乳酸脱氢酶A
• 预后
• 生物标志物
• 生物信息学

目的探讨乳酸脱氢酶A(LDHA)在肺腺癌(LUAD)中的表达及其临床意义。方法利用GEPIA2和Oncomine数据库挖掘LDHA基因在LUAD中的表达信息;人类蛋白质表达图谱(HPA)数据库分析LDHA蛋白表达;Ucalcan平台分析LDHA与LUAD临床病理特征的关系;Kaplan-Meier法分析该基因与LUAD患者预后的关系;LinkedOmics和Metascape工具进行基因本体(GO)分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,预测LDHA潜在分子调控机制;STRING-DB网站构建可视化蛋白互作网络(PPI)。结果 LUAD组织中LDHA mRNA表达水平是正常肺组织的2.44倍(P<0.05)。免疫组织化学结果表明,LDHA蛋白在LUAD组织中高表达。LDHA mRNA的表达与LUAD的病理分级和淋巴结转移数量呈正相关(P<0.05),与种族、性别、年龄和吸烟习惯无关(P>0.05),LDHA高表达者总生存期(OS)低于低表达者(logrank P<0.01,HR=1.9)。GO分析显示LDHA主要参与细胞分裂、细胞周期相变和嘌呤核糖核苷三磷酸代谢等过程,主要富集于中心颗粒体、微管、线粒体包膜等区域,主要与钙粘蛋白结合、单糖结合和激酶结合等功能相关;KEGG分析表明,LDHA共表达基因主要涉及糖酵解、磷酸戊糖途径、嘌呤代谢和糖异生等信号通路,26个LUAD相关基因编码的蛋白与LDHA存在互作关系。结论 LDHA在LUAD组织中高表达,影响LUAD的发生、发展和预后,有望成为LUAD诊断和药物治疗的重要靶点。

• 单位
  上海中医药大学附属龙华医院