甲型H1N1流感病毒HA蛋白抗原表位及受体结合位点突变特性的对比研究

作者：王舒宁; 李国庆; 吴迪; 曹志伟

来源：生物物理学报, 2012, (06): 486-498.

• H1N1流感病毒
• 抗原表位
• 受体结合位点
• 生物信息学研究 H1N1
• Epitope
• Receptor binding sites
• Bioinformatical analysis

人群中流行的H1N1病毒按其来源可分为两类:人感染的猪H1N1病毒与人类季节性H1N1流感病毒。这两类病毒在流行频率、易感性和致病性等方面存在明显差异。文章收集了1918～2009年间17株人感染的猪甲型H1N1毒株以及21株季节性H1N1毒株,通过序列比对、氨基酸残基保守性分析及3D结构对比等生物信息学方法,揭示造成这两类病毒流行病学和感染性差异的机制。研究发现这两类病毒HA蛋白的进化路径并不相同,且两者具有不同的突变特征,人感染的猪H1N1病毒中,Ca1、Ca2、Sa和Sb四个位点均较为保守,仅Cb位点的突变较快;季节性H1N1病毒仅有Ca1位点较为保守,其他四个抗原性位点均具有较快的突变...

• 单位
  生物反应器工程国家重点实验室; 上海生物信息技术研究中心; 华东理工大学