天津地区猪繁殖与呼吸综合征流行毒株ORF5基因的克隆及遗传变异分析

作者：李文忠; 荣新利; 刘野; 吴庆东; 张乐; 孙英峰; 于海

来源：中国动物传染病学报, 2023, 1-10.

DOI：10.19958/j.cnki.cn31-2031/s.20230210.003

• 猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒
• ORF5基因
• 序列分析
• 遗传变异
• 同源性分析

为了解天津地区猪繁殖与呼吸障碍综合征病毒(PRRSV)的流行和遗传变异情况，收集2021—2022年天津地区养殖场209份临床疑似发病猪的组织进行检测及ORF5遗传变异分析。结果表明：PRRSV阳性样品总检出率为37.3%（78/209），并从阳性样本中选择15个不同地区来源具有代表性样品进行ORF5基因克隆序列。序列及遗传进化分析显示，该15株PRRSV毒株均属于美洲型，其中8条PRRSV毒株的ORF5基因与以HuN4为代表的类HP-PRRSV毒株同源性较高，核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为89.4%-97.3%和80.6%-95.5%，而与NADC30、VR2332、NADC34等毒株的同源性较低，分别为77.1%-87.1%和77.1%-86.6%；6条PRRSV毒株的ORF5基因与以NADC30为代表的类NADC30毒株同源性最高，核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性分别为91.9%-92.7%和91.5%-93.0%，而与HuN4、VR2332、NADC34等毒株的同源性较低，分别为83.6%-87.8%和79.6%-86.6%；1条PRRSV毒株的ORF5基因与以NADC34为代表的类NADC34 毒株同源性最高，核苷酸序列与推导氨基酸序列的同源性为96.4%和95.5%，而与NADC30、HuN4、VR2332等毒株的同源性为86.7%-89.9%和86.6%-92.0%。结果表明，2021—2022年天津地区以类HP-PRRSV、类NADC30 PRRSV为主要流行毒株，同时出现类NADC34毒株的流行，存在明显的遗传多样性。研究结果可为天津地区PRRS的防控提供理论依据。

• 单位
  中国农业科学院上海兽医研究所; 天津农学院