Affymetrix基因芯片测序技术分析垂体对大鼠椎动脉型颈椎病模型的调控机制

作者：宋敏; 巩彦龙; 刘涛; 刘建鸿; 董万涛; 刘小钰; 侯红艳

来源：西安交通大学学报（医学版）, 2018, 39(02): 210-215.

• 基因芯片
• 垂体
• 椎动脉型颈椎病(CSA)
• 差异基因
• 基因表达谱
• 信号通路

目的分析椎动脉型颈椎病(CSA)模型大鼠垂体组织差异基因表达谱变化,探讨垂体对CSA的调控机制。方法将10只SPF级雄性Wistar大鼠随机分为模型组和正常组,采用复合造模法建立CSA模型,模型成功后取垂体组织,提取总RNA,用全基因芯片检测基因表达谱,筛选差异基因,进行基因本体论(GO)、信号通路分析差异基因在信号通路上的富集程度、分子功能和生物学过程。结果与正常组比较,差异基因表达谱分析显示:差异基因总数为321个(|fold change︱>2,P<0.05),其中表达上调的基因有203个,下调的有118个;富集的GO功能共有1 294条,涉及对细胞间信号转导活性的调节、神经细胞功能的调节、对外界刺激的应激反应及凝血功能的调节、血管形成的调节以及调节内膜系统、细胞周期等;参与调节的信号通路共有145条,包括脂肪细胞因子信号通路、TGF-β信号通路、AMPK信号通路、PPAR信号通路、Wnt信号通路、MAPK信号转导通路等。结论垂体对CSA的调控主要通过对炎性刺激、免疫调节、椎动脉功能及内膜系统等的调节实现。

• 单位
  甘肃中医药大学; 甘肃中医药大学附属医院