肝癌细胞应对TNF–α刺激过程中与细胞黏附相关的信号转导网络研究

作者:郑永昌; 杜顺达; 徐海峰; 徐意瑶; 赵海涛; 迟天毅; 卢欣; 桑新亭; 毛一雷*
来源:中华医学杂志, 2014, 94(42): 3345-3348.
DOI:10.3760/cma.j.issn.0376-2491.2014.42.015

摘要

目的利用生物信息学方法进一步认识肝癌细胞应对肿瘤坏死因子α(TNF–α)刺激过程中的细胞黏附相关的信号转导网络。方法利用肝癌细胞HepG2应对TNF–α刺激的基因芯片数据、转录因子数据库HTRI以及蛋白–蛋白相互作用数据库HRPD构建了肝癌细胞应对TNF–α刺激过程中的信号转导网络, 并利用网络结构和基因功能聚类的分析方法进行了研究。结果发现在信号转导网络中MYC、SP1等基因是信号转导网络中的关键转录因子, 信号转导网络中的基因与细胞黏附密切相关, EGFR很可能是肝癌细胞应对TNF–α刺激过程中调控细胞黏附的关键基因。结论 EGFR很可能在TNF–α引起的肝癌细胞迁移过程中发挥了关键作用。

  • 单位
    北京协和医学院; 北京协和医院; 中国医学科学院

全文