猪流行性腹泻病毒感染仔猪空肠组织的转录组学分析

作者：曾德平; 陆颖; 余科辰; 卢峥朴; 柏家果; 秦秋英; 隆美金; 陈樱; 韦祖樟; 黄伟坚; 欧阳康

来源：中国动物传染病学报, 2023, 1-9.

DOI：10.19958/j.cnki.cn31-2031/s.20230206.003

• 猪流行性腹泻病毒
• 转录组分析
• 差异表达
• RNA-Seq
• 先天免疫

猪流行性腹泻病毒（PEDV）感染仔猪可引起严重腹泻，导致肠道黏膜损伤、免疫功能低下。为探究PEDV感染仔猪空肠基因组转录水平的变化，筛选宿主免疫应答的差异表达基因，本研究收集PEDV感染仔猪的空肠组织，利用RNA-Seq技术进行转录组学测序分析。RNA-seq结果显示，与正常未感染仔猪相比，PEDV感染仔猪存在339个显著差异表达基因（DEGs），其中182个上调基因，157个下调基因。GO分子功能结果显示，免疫相关差异表达基因主要与免疫球蛋白和受体结合、T细胞增殖等有关；KEGG通路富集结果显示，差异表达基因主要涉及TNF信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、Toll样受体信号通路、Janus激酶/信号转导与转录激活子信号通路以及RIG‐I受体信号通路等；最后再利用qRT-PCR对差异表达基因进行验证，其结果与转录组学结果基本一致。本研究为进一步研究PEDV感染导致宿主免疫应答变化机制提供了科学依据。

• 单位
  广西科技大学; 广西大学