摘要
环糊精可作为主体通过超分子相互作用与客体分子形成包合物,从而起到保护或增强客体分子性质的作用。分子模拟是探究该相互作用的一种重要研究手段,在环糊精包合反应中得到了广泛的应用。本文首先对分子模拟进行概述,主要包括量子力学、分子对接和分子动力学模拟;其次,分别总结了分子对接和分子动力学模拟的基本原理、主流软件及常用力场等,之后分别从分子结构变化表征、分子间相互作用表征、溶剂效应及协同稳定4个方面总结了其在研究环糊精包合过程中的应用进展;研究表明,疏水空腔的大小及客体在空腔内的初始方向对客体/环糊精包合物结构都有非常重要的影响;范德华相互作用是环糊精包合反应的主要推动力,分子间氢键的形成是包合物稳定的重要因素;显式溶剂模型是研究环糊精包合反应溶剂效应的有利工具;最后,作者认为对于环糊精包合过程,可从多尺度及机器学习两方面,结合分子模拟进行后续相关研究。
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