2013-2021年在沈阳地区持续传播的柯萨奇病毒A组6型的分子进化研究

作者：王德成; 栗凡; 丛如意; 杨婷婷; 王冰^*

来源：病毒学报, 2023, 39(05): 1253-1260.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004370

• 手足口病
• 柯萨奇病毒A组6型
• VP1区
• 分子进化

手足口病（Hand foot and mouth disease,HFMD）是一种儿童常见的传染性疾病。持续的研究表明，柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）已经成为其主要病原。本研究为分析辽宁省沈阳地区CVA6的VP1区病原学特点及其分子进化特征，收集了2013-2021年沈阳地区手足口病患者标本，应用荧光定量PCR方法进行CVA6等肠道病毒核酸的检测，对CVA6核酸阳性标本应用RT-PCR方法针对VP1区全长进行扩增、核苷酸序列测定，使用MEGA软件进行遗传进化和氨基酸突变位点分析。结果表明2013-2021年间沈阳地区CVA6占肠道病毒阳性构成比的36.08%(1 269/3 517),2015年和2018年成为绝对优势流行株，分别为68.38%(240/351)和58.30%(316/542)。进化分析表明，2013-2021年间沈阳地区的CVA6均属于D3a基因型，其中2013-2014年CVA6位于D3a.1和D3a.2分支上，而2015-2021年毒株均位于D3a.2分支上。与参考株相比，沈阳地区CVA6的VP1蛋白上存在24个氨基酸突变位点。因此，CVA6为近年来沈阳地区手足口病的主要病原体之一，基于VP1区进化分析，可看出2013-2021年间沈阳地区CVA6均属于D3a基因型，且已由D3a.1分支进化到D3a.2分支，并持续流行至今。加强CVA6的持续性监测与病原特征分析，对HFMD的科学防控具有重要意义。

• 单位
  山东第一医科大学; 沈阳医学院; 辽宁省中医药研究院; 沈阳市疾病预防控制中心