高校内部控制体系优化是一项复杂的系统工程。近年来,高校的内控体系建设虽然取得了长足进步,但也出现了控制体系僵化、机构职能裂化、信息孤岛现象突出等问题。针对这一现实,本文通过借鉴西方公共治理理论中整体性治理理论,以寻求解决优化高校内部控制体系新的视角和思路。结合整体性治理理论,本文建议从明确责任边界,强化主体责任;再造工作流程,完善协调机制;技术优化制度,加强信息化建设等三个方面对高校内部控制体系优化提出合理性建议。