基于SSR扩增与测序分析的主栽烤烟品种遗传多样性研究

作者：田阳阳; 轩贝贝; 王正旭; 刘魁; 郭建华; 牟文君; 戴华鑫; 杨继周; 宋纪真; 胡利伟^*

来源：江西农业学报, 2021, 33(10): 73-79.

DOI：10.19386/j.cnki.jxnyxb.2021.10.011

• 烤烟
• SSR标记
• 毛细管电泳
• 遗传多样性
• 高通量测序

利用SSR荧光标记和毛细管电泳检测技术分析了SSR标记在8个烤烟品种烤后烟叶中的多态性和稳定性。结果表明:PCR产物浓度50～100 ng/μL为毛细管电泳检测较合适的上样浓度;利用83对SSR引物对8个烤烟品种进行PCR扩增,最终确定5对(NTGS66288、PT30250、PT30213、PT52573、PT30170)SSR引物为本研究的核心引物,且多态性分析表明这5对引物能够有效地将8个烤烟品种区分开;8个烤烟品种间的遗传相似性系数为0.30～0.86,当此系数为0.76时,云烟87、NC297、云烟97和中烟100聚为一类,K326和KRK26聚为一类,红花大金元、翠碧1号各自为一类;高通量测序结果显示NTGS66288、PT30250、PT30213、PT52573、PT30170等5个SSR位点基因座的核心重复单元多为简单二碱基重复和三碱基重复,且8个品种之间的差异仅为核心重复单元数量不同。

• 单位
  中国烟草总公司郑州烟草研究院; 红塔烟草（集团）有限责任公司; 红塔烟草(集团)有限责任公司