2017年Ⅱ型登革病毒汕头流行株的E基因序列分析

作者：郭川; 钟秀珠; 林洁敏; 陈婉; 张旭彬; 张志华

来源：中国病原生物学杂志, 2018, 13(06): 629-636.

DOI：10.13350/j.cjpb.180618

• 汕头市
• 登革病毒
• E基因
• 序列分析

目的阐明2017年汕头市2型登革流行株的基因型别,为其传播途径的分子流行病学研究提供依据。方法采集2017年汕头市疑似登革热患者血清标本,进行登革热病毒检测,阳性者进行全长E基因PCR扩增,对扩增产物进行序列测定,采用生物信息学软件Sequencher5.1、BioEdit和Mega6.0进行序列的比对分析并构建系统进化树。结果有4例血清标本检出登革热病毒2型核酸,其中2例的标本扩增出E基因全长序列(1 485bp),两者序列相似度100%,判定是由同一株病毒引起的感染。该流行株属于Cosmopolitan基因亚型,与东南亚毒株具有较高相关性。氨基酸序列分析显示该毒株E蛋白毒力位点的氨基酸为E126-E、E383385-E-P-G、E71-A和E390-S。结论汕头市2017年登革病毒流行株可能为东南亚毒株并发生一定变异,其E蛋白毒力位点的氨基酸为E126-E、E383385-E-P-G、E71-A和E390-S,属于弱毒株。

• 单位
  汕头市疾病预防控制中心