四川地区环境污水中诺如病毒分子流行病学研究

作者：曹冉冉; 刘李; 徐朝花; 任敏; 何吉兰; 马小珍^*

来源：中国病毒病杂志, 2022, 12(06): 458-462.

DOI：10.16505/j.2095-0136.2022.0061

• 诺如病毒
• 环境监测
• 污水
• 扩增子测序
• 宏病毒组测序

目的 探索四川地区环境污水中诺如病毒分子流行病学特征及环境监测的意义，同时对比2种高通量测序方法在环境监测中的应用，为病毒性病原环境监测提供技术参考。方法 2019年7—12月、2022年1—6月每月中旬在四川某污水处理厂进水口采集1 000 ml水样，经阴离子膜法浓缩富集后，提取核酸用实时荧光逆转录-聚合酶链反应(reverse transcription-polymerase chain reaction, RT-PCR)检测诺如病毒，再用扩增子测序和宏病毒组测序方法分别对诺如病毒衣壳区基因序列进行分析。结果 2019年7—12月、2022年1—6月共采集12份环境污水标本，GⅠ、GⅡ型诺如病毒检出率均为100.0%(12/12)。水样利用扩增子测序注释到17种型别诺如病毒，包括GⅠ.1～GⅠ.7、GⅡ.1～GⅡ.4、GⅡ.6、GⅡ.8、GⅡ.12、GⅡ.13、GⅡ.15、GⅡ.17,其中GⅠ.1、GⅡ.3、GⅡ.4相对丰度较高；2019年7—12月水样利用宏病毒组测序注释到4种型别诺如病毒和13种杯状病毒科其他属的病毒。结论 诺如病毒在四川地区环境污水中有很高的检出率，表明人群中有大量隐性感染者，且环境污水中检出多种在急性胃肠炎病例监测中少见或未见的诺如病毒型别，应继续加强环境监测，警惕诺如病毒急性胃肠炎的暴发流行。同时，在诺如病毒的环境监测中，扩增子测序较宏病毒组测序更为实用。

• 单位
  四川省疾病预防控制中心