摘要
为探究NLR Family Pyrin Domain Containing 6(NLRP6)在广西巴马小型猪的蛋白结构和组织表达水平,本实验以巴马小型猪为材料,通过克隆获取了NLRP6的CDS序列全长,并进行生物信息学和组织表达谱分析,同时采用qRT-PCR分析NLRP6基因在不同组织的表达分布情况。结果显示,NLRP6基因的CDS序列全长为2 640 bp,编码879个氨基酸。生物信息学分析表明,NLRP6蛋白分子式预测为C4294H6958N1234O1272S37,等电点为8.12,为亲水性碱性蛋白质。经氨基酸序列比对和物种进化树分析发现,广西巴马小型猪NLRP6基因与猪的遗传距离最近,其次是牛,与小鼠的遗传距离最远。qRT-PCR结果表明,NLRP6基因在肾脏组织表达最高,同时在小肠部位具有很高的表达水平,但在心脏和肌肉组织中表达量极低。本研究结果为进一步研究猪NLRP6基因提供了理论参考。
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