基于RNA-seq筛选白藜芦醇致猪卵巢颗粒细胞凋亡的可变剪接基因

作者：章会斌; 韩政; 刘阳光; 周忍; 陈一歌; 许黎明; 徐启隆; 殷宗俊^*; 张晓东^*

来源：中国畜牧杂志, 2022, 58(08): 36-44.

DOI：10.19556/j.0258-7033.20220524-01

• 白藜芦醇
• 颗粒细胞
• 转录组测序
• 可变剪接
• 猪

本研究旨在探究参与白藜芦醇（Resveratrol,RES）诱导猪卵巢颗粒细胞（Porcine Ovarian Granulosa Cells,pGCs）凋亡的可变剪接基因。实验以50、100μmol/LRES处理pGCs，并设置空白对照，利用转录组测序（RNA-seq）技术分析3组之间差异可变剪接基因的表达谱，对差异可变剪接基因进行GO和KEGG富集分析，通过qRT-PCR验证RNA-seq数据。结果表明，与对照组相比，低浓度组有198种基因参与了236个可变剪接事件，高浓度组有603种基因发生了779个可变剪接事件。在log2|FoldChange|>1、P<0.05条件下，分别在低浓度组筛选到6个、高浓度组筛选到35个差异可变剪接基因。GO分析显示，差异可变剪接基因主要参与生物学过程条目。KEGG分析发现，显著富集的通路均与激素分泌及代谢途径相关，如卵巢类固醇生成信号通路、氨基酸代谢相关信号通路等。进一步从中筛选出可能参与RES诱导pGCs凋亡的关键基因（AKR1C1、GLUL、SARDH、MADD基因）。综上，RES通过影响pGCs中基因的可变剪接，从而影响相关信号通路和生物学功能；同时，筛选出的关键基因可作为进一步研究RES调控pGCs凋亡机制的候选靶标。

• 单位
  动物科技学院; 安徽农业大学