玉米大斑病病菌对热带玉米种质CML493的DNA甲基化变异与mRNA表达分析

作者：李春雷; 苏桂华; 张辰; 孙伟峰; 祁新^*; 苏义臣^*

来源：玉米科学, 2020, 28(06): 52-58.

DOI：10.13597/j.cnki.maize.science.20200608

• 玉米
• 大斑病病菌
• DNA甲基化
• mRNA表达

以热带高抗大斑病玉米种质CML493幼苗为试验材料,采用人工接种大斑病病菌处理,采用甲基化敏感扩增多态性(MSAP)技术和转录组测序(mRNA-seq)技术,对经过接种大斑病病菌处理不同时间的CML493基因组DNA胞嘧啶甲基化进行DNA甲基化模式、DNA甲基化水平分析和mRNA表达分析。结果表明,接种大斑病病菌6、12 d的甲基化敏感扩增多态性分别为78.21%和76.13%,甲基化敏感扩增单态性分别为21.79%和23.87%。接种大斑病病菌6 d时,总甲基化率上升5.49%,全甲基化率上升14.24%,半甲基化率上升6.11%。接种大斑病病菌12 d时,总甲基化率上升6.40%,全甲基化率上升16.73%,半甲基化率上升5.57%。接种大斑病病菌0、6、12 d共检测到2 298个共表达基因,共检测到1 434个共表达上调基因,检测到769个共表达下调基因,上调基因数目显著多于下调基因数目。

• 单位
  吉林省农业科学院; 吉林农业大学