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摘要
目的利用数据库分析肝细胞癌(HCC)组织核转运蛋白XPO5基因水平及其与患者预后的关系。方法在Oncomine数据库,分析HCC组织XPO5基因水平,并在GEPIA数据库中选择TCGA数据进行验证。在MethHC数据库分析HCC组织XPO5基因甲基化水平。在GEPIA的TCGA数据库,分析XPO5基因水平对HCC患者生存期的影响以及不同病理学分级的HCC组织XPO5基因水平差异。在STRING数据库分析与XPO5相互作用的蛋白种类。结果与正常肝组织比,HCC组织XPO5基因呈高水平(P<0.01),且在病理学分级为III级组织XPO5基因水平最高;HCC组织XPO5基因高水平患者总体生存期和无病生存期较低水平患者显著缩短,差异具有统计学意义(P<0.01);HCC组织XPO5基因较正常肝组织甲基化水平显著降低,差异具有统计学意义(P<0.005),甲基化降低区域主要位于基因体区域;蛋白相互作用网络分析显示,XPO5与DICER1和RAN等蛋白相互作用,并参与了mi RNA的调控。结论 XPO5基因在HCC组织中呈高水平状态,这种高水平状态可能与癌组织不同病理学分级有关,并影响患者的生存期。采用数据库进一步挖掘分析研究结果可能为临床采用生物学方法 HCC患者提供参考依据。
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