通过转录组测序分析识别糖尿病患者冠状动脉粥样硬化的新途径

作者：陈丁源

来源：中国现代医学杂志, 2019, 29(07): 53-60.

• 冠状动脉疾病
• 糖尿病,2型
• 心外膜脂肪组织
• 序列分析

目的探究冠状动脉疾病(CAD)和2型糖尿病(T2DM)患者心外膜脂肪组织(EAT)的转录组变化。方法选取青海省心脑血管病专科医院8例CAD患者,并根据有无T2DM将患者分为糖尿病组(D组,n=5)和非糖尿病组(ND组,n=3)。对8例患者EAT样本进行RNA测序分析。基因富集分析以鉴定受差异表达基因影响的途径。通过逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)及Western blotting检测验证靶基因的变化。结果有592个基因在D组EAT中差异表达。在D组EAT中差异表达基因主要富集于炎症相关反应,例如CSF3、IL-1β,IL-6。KEGG通路分析证实,上调的基因参与炎症途径,如肿瘤坏死因子(TNF),NF-κB及AGERAGE。在氧化应激途径中通过实验验证两个差异有统计学意义的基因(FRA1和PTX3)。结论糖尿病EAT的转录组变化与高血糖引起的氧化应激密切相关,其基因的差异表达可能激活了氧化应激反应并促进糖尿病患者的动脉粥样硬化。

• 单位
  青海省心脑血管病专科医院