结球甘蓝CML家族基因及其在授粉后柱头中的表达

作者：蒲敏; 罗绍兰; 廉小平; 曾静; 张贺翠; 刘倩莹; 左同鸿; 朱利泉^*

来源：园艺学报, 2018, 45(11): 2129-2140.

DOI：10.16420/j.issn.0513-353x.2018-0177

• 甘蓝
• CML家族基因
• 生物信息学
• 表达分析

利用NCBI和甘蓝基因组数据库筛选获得了76个结球甘蓝CML家族基因,其随机分布在甘蓝的9条染色体上,染色体上最多的有12个基因,最少有1个基因。分析发现该基因家族编码蛋白氨基酸残基长度在109～365个之间,分子量大多在20 kD左右,为小分子蛋白,且均含有2～4个保守的EF-hand结构域。甘蓝的76个CML基因依据与拟南芥的CML家族的进化关系及序列相似性分为Ⅰ～Ⅷ个亚家族,每个亚家族基因有较高的同源性,进化关系较近。经亚细胞预测分析发现大部分蛋白在质膜和胞外表达,少量在质膜、细胞核内和叶绿体等部位表达。数字表达谱分析发现在76个基因中,有25个基因在自花和异花授粉后差异表达,其中BoCML12、BoCML42、BoCML44、BoCML45、BoCML60、BoCML70、BoCML71和BoCML74等8个基因在自花和异花授粉后表达趋势有较大差异,表明这8个基因以不同的方式参与调控甘蓝自花和异花授粉后的反应过程,有可能与甘蓝的自交不亲和性相关。

• 单位
  西南大学; 长江师范学院