摘要
[目的]分析比较10种富含精油植物mono-TPS核苷酸和氨基酸序列。[方法]通过生物信息学相关软件和网站比对和分析10种mono-TPS基因及蛋白序列,对其结构、理化性质、磷酸化位点、亲/疏水性、跨膜结构域、亚细胞定位、二级结构、功能域、三级结构及进化关系进行预测和分析。[结果]10种精油植物mono-TPS氨基酸序列结构与理化性质基本一致,具有亲水性,多不稳定,不含跨膜结构域;可能定位在质膜、线粒体内膜、细胞核或线粒体基质中;二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主要构件,序列中包括底物结合区、镁离子结合位点和天冬氨酸富集区,具有典型的植物萜类环化酶活性结构域,是Isoprenoid-Biosyn-C1超级家族成员之一,是一种类异戊二烯生物合成酶。通过进化树分析单萜合成酶,艾草与玉米进化程度相似。[结论]该研究结果可为精油植物单萜化合物的研究提供理论基础。
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单位河南省科学院