基于16S rRNA测序分析脂多糖结合蛋白基因敲除对小鼠肠道菌群的影响

作者：张振宇; 米传靓; 李思迪; 郭中坤; 陈志达; 王可洲^*

来源：中国医药生物技术, 2023, 18(02): 110-115.

• 脂多糖结合蛋白
• 炎症
• 16S rRNA
• 肠道菌群

目的 探究脂多糖结合蛋白基因(Lbp)敲除对小鼠肠道菌群结构的影响。方法 随机选取8只Lbp-/-小鼠作为Lbp-/-组，8只WT小鼠作为WT组。处死小鼠，解剖后取盲肠并编号，进行16S rRNA测序，采用OTU聚类分析、Alpha多样性分析、Beta多样性分析、门水平和属水平差异分析等方法分别对两组小鼠肠道菌群的丰度、多样性和物种组成进行研究。结果 与WT组相比，Lbp-/-组小鼠在门水平上，拟杆菌门(Bacteroidetes)相对丰度显著升高，柔膜菌门(Tenericutes)、厚壁菌门(Firmicutes)等相对丰度显著降低；在属水平上，拟杆菌属(Bacteroides)、普氏菌属(Prevotella)等相对丰度显著升高，Ⅳ梭菌属(Clostridium Ⅳ)、双歧杆菌属(Olsenella)等相对丰度显著降低。结论 Lbp敲除后拟杆菌属和普氏菌属丰度显著升高，这两类菌与多种肠道炎症性疾病密切相关，这为临床检测炎症相关疾病发生发展提供参考。

• 单位
  山东第一医科大学; 山东省医学科学院