玉木耳转录组测序及褐变相关基因的挖掘

作者：杨和川; 苏文英; 谭一罗; 周振玲; 秦裕营; 李晓^*

来源：江西农业学报, 2020, 32(05): 7-12.

DOI：10.19386/j.cnki.jxnyxb.2020.05.02

• 玉木耳
• 组织褐变
• 转录组测序
• 差异表达基因

为了从分子水平研究玉木耳褐变的机理,对褐变和未褐变的玉木耳子实体进行了转录组测序分析,共筛选到5915个差异基因,其中有924个Unigene上调表达,有4991个Unigene下调表达。通过基因本体(Gene Ontology, GO)富集分析发现,差异基因显著富集于细胞及代谢过程、单一有机体、细胞和细胞组分、细胞器和大分子复合体、结合作用和催化活性。KEGG代谢通路富集分析表明,富集程度比较显著的通路包括翻译通路、信号转导途径、内分泌系统、折叠排序及退化、运输和分解代谢通路。挑选与组织褐变相关的差异基因进行qRT-PCR表达模式验证,获得的结果与表达谱分析结果一致。

• 单位
  吉林农业大学; 江苏省连云港市农业科学院