一组新氨基酸描述子用于肽定量构效关系研究

作者：梁桂兆; 周鹏; 周原; 张巧霞; 李志良

来源：Acta Chimica Sinica, 2006, (05): 393-396+360.

• 肽
• 定量构效关系
• 主成分分析
• 遗传算法
• 偏最小二乘法 peptide
• quantitative structure-activity relationship
• principal component analysis
• genetic algo- rithm
• partial least square

用主成分分析从20种天然氨基酸0D～3D结构信息中收集到的共1369个描述子变量得到了一组新氨基酸描述子(SZOTT),将其用于血管紧张素转化酶抑制剂和苦味二肽结构表征并以偏最小二乘法建立定量构效关系模型,得复相关系数RCU2分别为0.894和0.908,留一法交互检验的复相关系数RCV2分别为0.828和0.736,估计均方根误差RMS分别为0.331和0.195.研究结果表明,SZOTT描述子含信息量大,操作简便,结构表达能力强,有望在多肽定量构效关系研究中得到进一步推广.

• 单位
  化学生物传感与计量学国家重点实验室; 生物工程学院; 化学化工学院; 湖南大学