狗枣猕猴桃AkMYB5基因的生物信息学分析

作者：刘丹; 李然红; 陈鑫; 王立凤

来源：湖北农业科学, 2020, (11): 134-137.

DOI：10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2020.11.028

• 狗枣猕猴桃[Actinidia kolomikta(Maxim. et Rupr.)Maxim.]
• AkMYB5
• 生物信息学 Actinidia kolomikta(Maxim.et Rupr.)Maxim.
• bioinformatics

为研究狗枣猕猴桃[Actinidia kolomikta(Maxim. et Rupr.)Maxim.]AkMYB5的功能,利用生物信息学工具和方法,对其编码蛋白质的理化性质、亲水/疏水性、跨膜结构、结构功能域、二级结构、三级结构、蛋白质修饰位点及同源性等进行分析和预测。结果表明,AkMYB5的cDNA全长为1 339 bp,CDS为1 053 bp,编码蛋白由351个氨基酸构成的亲水性非稳定蛋白,属于MYB5蛋白家族(PLN03212),主要构件为α-螺旋和不规则卷曲,与其他18种植物的MYB氨基酸序列进行比对发现,其与中华猕猴桃变种(Actinidia chinensis var. chi...

• 单位
  牡丹江师范学院