2022年盐城市新型冠状病毒全基因组分子特征分析

作者：陈国清; 王瑶; 安然; 李敏敏; 王兰华; 王富华; 徐士林

来源：江苏预防医学, 2023, 34(02): 145-191.

DOI：10.13668/j.issn.1006-9070.2023.02.008

• 新型冠状病毒
• 全基因组
• 高通量测序
• 序列分析
• 基因特征

目的 分析2022年盐城市部分新型冠状病毒的分子进化特征。方法 通过高通量测序技术，对2022年5月以来盐城市新冠病毒代表样本进行全基因组测序，采用生物信息软件从核苷酸、氨基酸和分子进化3个层面进行分子特征分析。结果 盐城市代表毒株主要位于3个进化谱系，5—7月的毒株位于BA.2.2进化谱系，9月以后的毒株主要位于BF.7和BA.5.2进化谱系，在各自进化谱系中形成众多进化分支。代表毒株S蛋白在一些关键位点上均发生了D614G、N501Y、E484A和L452R位点的变异，其他氨基酸位点变异呈散在性分布。结论 2022年盐城市新冠病毒的流行主要由输入病例造成散发或局部暴发，以BA.2.2、BA.5.2和BF.7为主，随着在人群中流行、时间推移可能会持续发生核苷酸位点的漂移；应加强新冠病毒株变异监测力度，及时发现能引起重症及流行的变异株。