2017—2019年上海市松江区诺如病毒感染性腹泻疫情的病毒基因型特征分析

作者：乔雪飞; 刘玲; 吴健灏; 李萌; 俞佳莉; 李欣; 吕锡宏; 吴佳瑾^*

来源：中华预防医学杂志, 2021, 55(11).

• 腹泻
• 基因型
• 横断面研究
• 诺如病毒

目的了解2017—2019年上海市松江区诺如病毒感染性腹泻疫情病毒基因型特征。方法收集上海市松江区2017—2019年69起由诺如病毒引起的感染性腹泻疫情的流行病学资料及相关样本, 用针对诺如病毒ORF1和ORF2连接区进行基因测序的方法进行诺如病毒基因测序及型别鉴定。结果 2017—2019年, 上海市松江区共报告诺如病毒感染腹泻疫情69起, 共检测1 767份样本:619份病例样本(诺如病毒阳性率19.9%), 343份从业人员样本(诺如病毒阳性率1.1%), 505份环境样本(诺如病毒阳性率0.5%)和300份食品样本(未检出)。测序获得141株基因序列, 基因型别分析显示2017年和2018年主要引起感染性腹泻的基因型别为GII.P16-GII.2(50.98%, 26/51), 而2019年引起感染性腹泻的基因型别中GII.P16-GII.2(13.73%, 7/51)和GII.Pe-GII.4(9.80%, 5/51)较多。结论引起上海市松江区2017—2019年诺如病毒感染的69起腹泻疫情病毒主要的基因型别为GII.P16-GII.2, 呈明显的春、秋冬季高峰, 且幼儿园及学校的事件较多。