原发性干燥综合征患者唾液腺组织ceRNA调控网络的构建

作者：吴玲玲; 凌华云; 周颖; 邱丽娟; 王红; 薛昱; 陈慧娟; 王廷睿; 王斌^*

来源：中华疾病控制杂志, 2022, 26(07): 777-814.

DOI：10.16462/j.cnki.zhjbkz.2022.07.006

• 原发性干燥综合征
• ceRNA调控网络
• 生信分析
• 信使RNA
• 长链非编码RNA
• 微小RNA

目的 通过生物信息学方法构建原发性干燥综合征(primary Sj?gren’s syndrome, pSS)患者唾液腺组织中的竞争内源性RNA(competing endogenous RNA, ceRNA)调控网络并探讨其发病机制。方法 利用基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus, GEO)对pSS患者唾液腺组织中的信使RNA(messenger RNA, mRNA)、长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)表达谱作差异分析。通过miRcode数据库和3个miRNA数据库(TargetScan、miRDB和miRWalk)获取与pSS有关的靶微小RNA(microRNA, miRNA)和靶mRNA,构建lncRNA-miRNA-mRNA的ceRNA调控网络，对ceRNA网络中差异表达基因(differentially expressed mRNAs, DEmRNAs)进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路富集分析。结果 在ceRNA网络中有214个DEmRNAs。KEGG分析显示DEmRNAs的主要富集信号通路为丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase, MAPK)信号通路和腺苷酸活化蛋白激酶(AMP-activated protein kinase, AMPK)信号通路，DEmRNAs中10个枢纽(Hub)基因分别为JUN、CCND1、NRAS、DDX5、KAT2B、VEGFA、SIRT1、CLTA、MCM7和RPS6KA1。结论 本研究通过构建ceRNA调控网络，发现网络中DEmRNAs主要富集MAPK和AMPK信号通路，为进一步深入探讨原发性干燥综合征的诊断和治疗提供了新的思路。

• 单位
  公共卫生学院; 安徽医科大学