科研之友
微信
新浪微博
Facebook
分享链接
摘要
AP2/ERF转录因子在植物中存在广泛，其参与植物生长发育及非生物胁迫等一系列生物过程。本研究利用前期西瓜耐旱相关的转录组数据进行筛选，通过RT-PCR技术克隆一个AP2/ERF转录因子基因ClERF5，并对其进行生物信息学分析。结果表明，ClERF5基因CDS序列长度为1 014 bp，有完整开放阅读框，编码337个氨基酸，存在保守的AP2/ERF结构域，不存在跨膜结构，内部以无规则卷曲和α-螺旋为主，为亲水性蛋白。该转录因子蛋白与苦瓜McERF5蛋白的同源性最高。利用RT-qPCR检测西瓜AP2/ERF在不同组织和干旱胁迫时间下的表达变化，结果显示西瓜ClERF5在不同干旱时间胁迫下均表达上调，并在6 d时达到峰值，表明该基因可能对植物干旱胁迫有响应。组织表达量分析表明，ClERF5在根中的表达量最高。本研究为深入揭示西瓜ClERF5在干旱胁迫应答中的功能及调控机制提供了实验基础。
- 单位
