脓肿分枝杆菌感染THP-1巨噬细胞自噬相关分子的识别

作者：周婷; 肖四方; 石国民; 喻容; 马小华; 周前选; 向延根^*

来源：生命科学研究, 2022, 26(06): 549-556.

DOI：10.16605/j.cnki.1007-7847.2021.08.0198

• 脓肿分枝杆菌(MAB)
• THP-1巨噬细胞
• 自噬
• 生物信息学

为了探索THP-1巨噬细胞在脓肿分枝杆菌(Mycobacterium abscessus, MAB)感染后,与自噬相关的关键分子及其介导的生物学过程,从GEO和GeneCards数据库中挖掘MAB感染后THP-1巨噬细胞的自噬相关基因;利用DAVID在线工具对筛选的差异自噬相关基因进行基因本体论(GO)、京都基因和基因组数据库(KEGG)富集分析;采用实时荧光定量PCR (qRT-PCR)方法验证筛选的关键基因;将关键基因与自噬标志分子MAP1LC3A进行Pearson相关性分析。生物信息学分析显示,与自噬密切相关的差异表达基因共11个,其中前5个是BNIP3 (Bcl-2/adenovirus E1 B interacting protein 3)、BAMBI (BMP and activin membrane bound inhibitor)、MAP1LC3A (microtubule associated protein 1 light chain 3)、DYSF (Dysferlin)和MYOZ1 (Myozenin1);功能预测显示, 11个差异表达基因主要和自噬等过程相关; qRT-PCR验证结果显示, BNIP3、MAP1LC3A和MYOZ1在两种表型MAB感染后的THP-1巨噬细胞中的变化与转录组测序(RNA-seq)结果一致,且BNIP3在RNA-seq和qRT-PCR结果中差异最显著(P<0.05); Pearson相关性分析显示, BNIP3与MAP1LC3A的相关性最强(P<0.05)。综上所述, BNIP3是MAB感染THP-1巨噬细胞后与自噬相关性最强的自噬相关分子,这可能为MAB感染巨噬细胞后的自噬过程的分子机制研究提供重要的启示。

• 单位
  南华大学