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摘要
长江鲟(Acipenser dabryanus)为中国特有鱼类，已被国际自然保护联盟(IUCN)列为极危级(CR)物种。通过Illumina高通量测序技术，探究了长江鲟幼鱼黏液、肠道内容物及其养殖水体的微生物菌群组成、多样性及动态变化，以期为长江鲟幼鱼健康养殖和病害分析提供参考依据。结果显示：养殖水体微生物多样性最高，黏液次之，肠道内容物最低。黏液和肠道内容物微生物菌群结构更为相似，且可与养殖水体微生物菌群区分开来。在门水平，黏液和肠道内容物均以放线菌门、变形菌门和厚壁菌门为主；养殖水体则以变形菌门、拟杆菌门和厚壁菌门为主。研究还发现7种可能的病原菌在养殖水体和黏液中富集，当鱼体处于应激状态或养殖环境恶化时，可能导致病害发生。BugBase表型预测分析发现，长江鲟幼鱼黏液、肠道内容物及其养殖水体中存在革兰氏阴性菌和阳性菌。其中肠道内容物的优势菌群为革兰氏阳性菌，占比超过60%；黏液和养殖水体的优势菌群均为革兰氏阴性菌，占比分别为60%和70%。在氧气需求方面，黏液和肠道内容物以好氧菌为主，养殖水体以好氧菌和兼性厌氧菌为主。
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单位中国长江三峡集团有限公司中华鲟研究所
