15个VNTR位点用于87株丽水市结核分枝杆菌分离株的基因分型研究

作者：雷永良; 陈秀英; 梅建华; 陶毅; 兰进权; 王晓光

来源：中国卫生检验杂志, 2012, (09): 2011-2013+2017.

• 结核分枝杆菌
• 基因分型
• 聚类分析
• 数目可变串联重复序列技术 Mycobacterium tuberculosis
• Genotyping
• Cluster analysis
• Variable number of tandem repeats

目的:选取2008年-2010年间丽水市结核分枝杆菌临床分离株,通过多位点可变数目串联重复序列分型,了解丽水市结核分枝杆菌流行菌株基因分型情况。方法:对临床分离株进行常规培养,收集菌体,提取基因组DNA,采用聚合酶链反应(PCR)分别对15个VNTR位点进行检测分析,基因聚类分析采用BioN-umerics软件。结果:经聚类分析,87株结核分枝杆菌分为4个基因群(I群、Ⅱ群、Ⅲ群、Ⅳ群)69个基因型。其中Ⅳ群占74.7%,含49个基因型,I群占9.2%,含8个基因型,Ⅱ群占8%,含7个基因型,Ⅲ群占5.75%。含5个基因型。结论:丽水市的结核分枝杆菌存在基因多态性,其主要流行型为Ⅳ型。