摘要
目的通过网络药理学构建三七合剂的活性成分-肝缺血再灌注损伤(hepatic ischemia-reperfusion injury,HIRI)靶点-生物通路的网络关系,探讨三七合剂干预HIRI的关键靶点及作用机制。方法通过国内外文献调研和中药系统药理学分析平台(TCMSP)及Pharm Mapper、Swiss Target Prediction等服务器,以口服利用度(OB)和类药性(DL)作为限定条件筛选并收集三七合剂干预HIRI的相关靶点;利用OMIM数据库筛选并整理HIRI相关的基因和蛋白靶点。利用Excel表合并、整理成分与疾病靶点的交集,通过Cytoscape3.7.2软件的插件Network Analyzer分析,以拓扑参数度(degree)≥5(平均自由度为4.5)为筛选条件找到核心靶点,并将交集靶点导入STRING服务器,并以置信度得分(Confidence Score)≥0.85为筛选条件构建核心蛋白互作(Hub-PPI)网络;将交集靶点导入FunRich 3.0软件进行生物学过程和生物学通路分析,利用Cytoscape3.7.2构建中药-活性成分-HIRI靶点-生物学通路网络。结果三七合剂能降低HIRI小鼠天门冬氨酸转氨酶(AST)及谷氨酸转氨酶(ALT)的表达(P<0.01);三七合剂经筛选得到45个活性成分,对应靶点3 273个,主要化合物包括熊果酸、齐墩果酸、马钱子苷、槲皮素、人参皂苷F2、芍药苷等;整理HIRI得到196个靶点,其与成分的交集靶点为46个,主要包括11-β-羟类固醇脱氢酶(HSD11B1)、腺苷受体A3(ADORA3)、环氧化酶2(PTGS2)、腺苷受体A1(ADORA1)、蛋白激酶C-ε(PKCε)等;经STRING服务器设定ConfidenceScore≥0.85的限定条件,得到高置信度PPI网络并经cluster处理将其聚为3类;经FunRich软件分析得到蛋白质代谢作用、信号传导、酶活性的负调控、炎症反应、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路共5条生物学过程(P<0.05);整合素连接激酶信号、TNF受体信号通路、p38丝裂原活化蛋白激酶信号通路、TRAIL信号通路等16条生物通路(P<0.01)。结论初步探讨了三七合剂干预HIRI是通过多成分和多靶点的相互作用,及调控多条生物通路及生物学过程共同完成的,但关键的核心靶标和具体的调控机制尚待进一步的实验验证。
-
单位天津市第一中心医院