HCC组织CDC20表达及其与发病机制的关系研究

作者：邹春燕; 何焰鹏^*; 柴秀坤; 谢长顺; 李莉; 付丽坤

来源：实用肝脏病杂志, 2023, 26(01): 95-99.

• 肝细胞癌
• 细胞分裂周期20
• GEO数据
• 差异表达基因

目的 肝细胞癌(HCC)是世界上最常见的肝恶性肿瘤之一。HCC的病因和潜在的分子事件尚不清楚。我们应用综合生物信息学技术识别与HCC相关的关键致病基因细胞分裂周期20(CDC20),并揭示其潜在的分子机制。方法 从Gene Expression Omnibus (GEO)数据库下载GSE36376基因表达谱，共433个样本，其中HCC组织240例，正常肝组织193例，用综合生物信息学方法进行深入分析。应用RStudio中的R软件筛选HCC和正常肝组织差异表达基因(DEG),从STRING数据库中构建DEG的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络，应用Metascape在线工具进行富集分析，采用MCODE法对Hub基因进行鉴定。结果 筛选GSE36376数据集得到706个DEG,其中共鉴定出554个下调基因和152个上调基因；从PPI网络中鉴定出DEG关系基因，显著上调基因是UBE2C、CDC20、COL4A1、NUSAP1、HSP90AB1和CDKN3;Metascape富集分析表明，在GO生物过程中，主要集中在小分子分解代谢过程、一元羧酸代谢过程、类固醇代谢过程、辅因子代谢过程、药物分解代谢过程、初级酒精代谢过程、对有毒物质的反应、有机阴离子转运、单糖代谢过程、芳香族氨基酸家族代谢过程、解毒作用、伯醇分解代谢过程和有机环状化合物分解代谢过程等；在KEGG信号通路中，主要集中在碳代谢、脂肪酸降解、补体和凝血级联、色氨酸代谢和过氧物酶体等过程；MCODE分析显示Hub基因是UBE2C、CDC20和HSP90AB1。结论 应用综合生物信息学方法筛选出的CDC20基因是HCC发生发展的关键基因，对HCC的早期诊断和预防具有临床意义，为HCC的防治提供了有效的靶点。

• 单位
  河北医科大学第二医院