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摘要
为鉴定水牛长链脂酞辅酶A合成酶(long-chain fatty Acyl-CoA synthetases,ACSLs)的家族成员并探究该基因家族在泌乳方面的功能，通过生物信息学技术对水牛ACSL基因家族进行了motif、基因结构分析、共线性分析、不同物种系统进化分析，运用qPCR技术检测ACSLs在不同组织的mRNA表达量。结果表明：水牛ACSL基因家族共有5个家族成员并分别命名为bbu.ACSL1、bbu.ACSL3、bbu.ACSL4、bbu.ACSL5和bbu.ACSL6。染色体分布情况结果显示：bbu.ACSL1位于1号染色体，bbu.ACSL3位于2号染色体，bbu.ACSL4位于25号染色体，bbu.ACSL5位于23号染色体，bbu.ACSL6位于9号染色体。这5个ACSL氨基酸数在699～722 aa,所有蛋白的等电点除ACSL6外均大于7.00。Motif分析发现，除ACSL3和ACSL4缺少motif8外，其余均含有预测出的Motif 1～10,且排序相同。物种内共线性分析结果显示，水牛和普通牛中均不存在串联重复和片段重复，种间共线性分析结果显示，水牛ACSL与普通牛ACSL存在4对片段重复基因。不同物种ACSL系统发育分析显示，ACSL基因家族具有较高的保守性，其中水牛与普通牛和牦牛的聚类更为相近。不同组织表达量分析发现ACSL1、ACSL3在乳腺组织的mRNA表达量高于其他组织，ACSL6在大脑的mRNA表达量高于其他组织，ACSL4在肺部的mRNA表达量高于其他组织，ACSL5在肝的mRNA表达量高于其他组织。根据RNA-seq测序结果分析不同泌乳时期表达量结果显示，ACSL1在整个泌乳期均有高表达量，尤其是在泌乳第50、140和280天。ACSL3和ACSL5在泌乳第7天和第50天高表达，但随着泌乳天数增加，表达量降低。ACSL4和ACSL6在泌乳第7天表达量最高，但在整个泌乳期的表达量均远低于该家族的其他3个成员。
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单位中国农业科学院广西水牛研究所; 广西壮族自治区水牛研究所
