摘要
目的 研究2021年引发成都市急性胃肠炎聚集性疫情的诺如病毒GII.P16-GII.4 Sydney_2012株的遗传进化和分子病原学特征。方法 采集2021年1—12月成都市65起急性胃肠炎聚集性疫情病例粪便及肛拭子样本825份,采用实时荧光定量PCR检测。结果为阳性的样本经由常规RT-PCR对RdRp区和VP1区扩增后测序,以BioEdit、MEGA-X将所得序列与全球各参考株序列比对并构建进化树,对其同源性、氨基酸变异、蛋白质三维结构等基因特征进行分析研究。结果 自上述65起疫情检出7种诺如病毒基因型,其中13起由Sydney_2012株引起。比对分析结果显示,其同一起Sydney_2012疫情中标本序列相似性为98.6%~100%,疫情之间序列相似性为96.2%~100%。结论 Sydney_2012株可能成为成都地区流行的优势株,甚至有引起爆发疫情的可能性。持续加强诺如病毒疫情监测,有助于提升防控预警能力。
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单位四川省疾病预防控制中心; 成都市成华区疾病预防控制中心