南通地区9株4型星状病毒的全基因组序列分析

作者：季霄雷; 郭陈; 丛辉; 熊海平; 陈璐; 陈雨佳; 孙怡华; 严炳清; 蔡秀丽; 苏婧; 梁如悦; 陈诗瑶

来源：病毒学报, 2023, 39(05): 1261-1271.

DOI：10.13242/j.cnki.bingduxuebao.004344

• 星状病毒
• 全基因组
• HAstV-4c
• 病毒重组
• 选择压力分析

人类星状病毒（Human astrovirus,HAstV）是全球流行的引起急性胃肠炎常见病原体，主要引起幼儿、老年人及免疫功能低下人群的感染。本研究收集了江苏南通地区定点监测医院门、急诊<5岁儿童急性胃肠炎腹泻监测粪便标本712份，共检测出HAstV阳性22例。对Ct<30的样本进行病毒的分离培养，共得到9个HAstV分离株。对这9个分离株进行了全基因组的测序及分析，以表征其遗传变异及进化特征。所有分离株经blastn比对后，发现其基因序列均与4型HAstV一致性最高。与HAstV-4原型株MK059952相比有较大变异，核苷酸一致性为88.15%～91.98%。重组分析发现9个分离株呈现出两种不同的进化重组方向。氨基酸置换熵值分析及选择压力分析发现有3个氨基酸位点同时满足易突变位点及适应性演化位点，这可能是HAstV能持续在全球流行的因素之一。本研究为南通地区流行的HAstV的遗传多样性和重组提供了进一步的证据，对HAstV引起相关疾病的预防控制将发挥重要作用。

• 单位
  南通大学附属医院; 南通市疾病预防控制中心; 南通大学